第十季开篇以一名核心成员的牺牲震惊开场。在葬礼上，吉布斯接到神秘线报：牺牲者并非死于战场流弹，而是因为他发现了潜伏在NCIS内部数十年的“沉睡间谍网”。这个代号“冬眠者”的组织成员皆为资深探员，他们奉命在和平时期潜伏，伺机窃取海军核心机密。本季采用双线叙事：一条线是团队追查渗透者，每集揪出一人却总被抢先灭口；另一条线则倒叙十年前，展示这群人如何被招募、训练并安插进NCIS。当怀疑指向最不可能的那个人时，吉布斯必须在48小时内证明对方清白，否则整个NCIS将被国会强制解散。
这一季将单元剧模式彻底打破，变为整季连续悬疑剧，堪称系列最强文戏。情感冲击力极强，尤其是对团队忠诚度的拷问，让追了十年的老观众看得心如刀割。
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